Informatiker / Bioinformatiker (m/w/d)

Die Charité - Universitätsmedizin Berlin ist eine gemeinsame Einrichtung der Freien Universität Berlin und der Humboldt-Universität zu Berlin. Sie hat als eines der größten Universitätsklinika Europas mit bedeutender Geschichte eine führende Rolle in Forschung, Lehre und Krankenversorgung inne. Aber auch als modernes Unternehmen mit Zertifi­zierungen im medizinischen, klinischen und im Management-Bereich tritt die Charité hervor. Das Berliner Institut für Gesundheitsforschung | Berlin Institute of Health (BIH) ist eine Wissenschafts­einrichtung für Translation und Präzisionsmedizin. Das BIH widmet sich neuen Ansätzen für bessere Vorher­sagen und neuartigen Therapien bei progredienten Krankheiten, um Menschen Lebensqualität zurück­zugeben oder sie zu erhalten. Mit translationaler Forschung und Innovationen ebnet das BIH den Weg für eine nutzen­orien­tierte personalisierte Gesundheitsversorgung. Das BIH wird zu 90 Prozent vom Bundes­ministerium für Bildung und Forschung (BMBF) und zu zehn Prozent vom Land Berlin gefördert. Die Gründungs­institutionen Charité – Universitätsmedizin Berlin und Max-Delbrück-Centrum für Molekulare Medizin in der Helmholtz-Gemeinschaft (MDC) sind im BIH eigenständige Gliedkörperschaften. Informatiker / Bioinformatiker (m/w/d) Im Zentrum für digitale Gesundheit unter der Leitung von Professor Dr. Roland Eils wird innovative Gesund­heits­forschung in den Bereichen Informatik, Genomik und personalisierte Medizin betrieben. In diesem spannenden Forschungsumfeld werden hochkomplexe Analysealgorithmen in Big Data Analytics, Künstliche Intelligenz und DEEP Learning im nationalen und internationalen Kontext entwickelt und eingesetzt. Als (Bio-)Informatiker unterstützen Sie die technische Umsetzung unserer wissenschaftlichen Programme in eine professionelle Architektur. In diesem für die Medizinforschung technologisch anspruchsvollen Umfeld suchen wir engagierte und motivierte Mitarbeiter zum Neuaufbau unseres innovativen Teams.

• Unterstützung beim Aufbau des IT-Teams
• Wissenschaftliche Unterstützung bei der Umsetzung von neuesten IT-Technologien
• Optimierung und Einbinden von Applikationen und Workflows im Bereich der Lebenswissenschaften
• Konzeptionelle Unterstützung und Etablierung unserer wissenschaftlichen Rechenzentren
• Enge Zusammenarbeit mit unseren wissenschaftlichen Entwicklerteams
• Enge Zusammenarbeit in führenden internationalen Cloudprojekten (https://www.elixir-europe.org/, https://ec.europa.eu/research/openscience/, https://www.humancellatlas.org/)
• Vertretung bei wissenschaftlichen Projektveranstaltungen sowie Präsentationen bei (inter-)nationalen Tagungen

Abgeschlossenes Hochschulstudium in einem naturwissenschaftlich-technischen Fach, vorzugsweise (Bio-)Informatik oder einem anderen naturwissenschaftlich-technischen Studiengang

• Für die Position erforderlich sind:
  • Tiefgehendes Verständnis von IT-Technologien und umfangreiche Kenntnisse in Unix/Linux und Scripting (z. B. Shell, Python, Perl)
• Weitere Kenntnisse, auch in Teilbereichen, sind vorteilhaft:
  • Erfahrungen in Paket- und Containertechnologien (z. B. Conda, Docker, Singularity)
  • Kenntnisse in Bezug auf APIs
  • Kenntnisse über Workflow Management-Systeme (z. B. Galaxy, snakemake, nextflow)
  • Grundkenntnisse im Umfeld von Next Generation Sequencing
  • Grundkenntnisse im Umfeld von Automatisierung und Orchestrierung (z. B. Ansible, Puppet)
  • Kenntnisse in der Administration komplexer Cloud / HPC-Systeme
• Zusätzlich erforderlich sind
  • Zuverlässigkeit, Eigeninitiative, Teamfähigkeit und hohe Leistungsbereitschaft
  • Hervorragende Kommunikations- und Organisationsfähigkeiten
  • Sehr gute Deutsch- und Englischkenntnisse in Wort und Schrift